生理活性させる一番の原因は光や水ですが、それと同様に自身が持っているホルモンは重要です。ミネラルやカロチノイド等の炭水化物やアミノ酸等から造られます。呼吸することからはじまり、樹や根の発育と発芽や発根の栄養成長、花をつくり受精、結実にいたる生殖成長は遺伝子でコントロールされて季節にあった生理を実現しています。

遺伝子をつくる過程でシトクロムＰ４５０が大きく係わり、植物は人の５７種類よりも遙かに多く（試験用植物シロイロナズナはＣＹＰ２７２個）存在します。その物質は酵素やホルモン等の生理活性に係わる遺伝子であったり、他の遺伝子の発現に係わっていることが多く、ヘモグロビンのヘム同様に鉄の酸化還元から酸素や栄養素の供給にも働きます。酵素作用やホルモン作用を発現させる上でプロトン（Ｈ＋）の動きが重要で、各酵素やモルモン、葉緑体等の活性に係るミネラルの動きは非常に重要となります。

植物生理活性ホルモン：オーキシン、サイトカイン、ジベレリン、エチレン、アブシジン酸、ブラシノステロイド、ジャスモン酸、ペプチドホルモン、フロリゲン、ストリゴラクトン、サリチル酸に加えマイクロRNAをホルモン物質として研究されてます。